用滑鼠控制，點選兩個有分子鏈互相連結且數字相同的原子，即可將兩原子融合成一個數字加1的新原子，拖曳畫面可旋轉整個原子結構；隨著關卡演進還有更多特殊的原子與分子鏈，如：藍色的分子鏈可以讓兩顆原子無限制的互換位置、紅色的分子鏈可以互換位置一次、四則運算的原子...等；設法讓所有原子融合到只剩最後一個原子即可破關。